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  • Les scientifiques américains veulent séquencer les ADN de 100.000 pathogènes d'origine alimentaire

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    Les scientifiques américains projettent de cartographier en 5 ans les codes génétiques de 100.000 pathogènes d'origine alimentaire, en particulier les bactéries e. coli, salmonella et listeria afin de résoudre plus rapidement les épisodes sanitaires dont sont victimes les consommateurs.

    La Food and Drug Administration (FDA) a déclaré le 12 juillet que les séquences de ces micro-organismes pathogènes seront publiées dans une base de données publique. Elles serviront à la création de tests d'identification des micro-organismes pathogènes et donneront des indices sur leurs origines. 

    Environ 48 millions d’américains, soit une personne sur six, sont victimes d’intoxication alimentaire chaque année, et 3.000 en meurent.

    Ce projet dénommé « 100 K Genome », aidera les chercheurs à développer des tests pour identifier les bactéries d'un échantillon dans un délai beaucoup plus court de l’ordre de quelques jours, voire d’heures au lieu d’une semaine. Les génomes seront mis à la disposition des développeurs de tests commerciaux.

    Un tel projet est rendu aujourd’hui possible grâce à la chute des coûts du séquençage des génomes, chaque génome constituant un ensemble complet de chromosomes.

    La FDA fournira plus de 500 séquences du génome de salmonella. Au départ, le projet se concentrera sur des bactéries alimentaires courantes, telles que e. coli et listeria. Il intégrera ensuite des virus comme le norovirus et certains parasites comme le cryptosporidium.

    La FDA travaille sur ce projet avec Agilent Technologies Inc. (A), les Centres de Prévention et de Contrôle des Maladies et l'Université de Californie à Davis. Agilent est un fabricant d'équipement de mesure électronique et bio-analyse basé à Santa Clara en Californie. Il fournira l'expertise scientifique d'instrumentation et participera au financement du programme de recherche réalisé à l'Université de Californie.

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